MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia psittaci 01DC12 plasmid p01DC12

Total Repeats: 150

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019392	CAC	3	9	165	173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410858955
2	NC_019392	ATT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410858955
3	NC_019392	AGC	2	6	203	208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410858955
4	NC_019392	AGAA	2	8	243	250	75 %	0 %	25 %	0 %	410858955
5	NC_019392	TAG	2	6	274	279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410858955
6	NC_019392	AT	3	6	286	291	50 %	50 %	0 %	0 %	410858955
7	NC_019392	TGT	2	6	324	329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410858955
8	NC_019392	AGC	2	6	416	421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410858955
9	NC_019392	TA	3	6	426	431	50 %	50 %	0 %	0 %	410858955
10	NC_019392	TTA	2	6	469	474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410858955
11	NC_019392	AG	3	6	558	563	50 %	0 %	50 %	0 %	410858955
12	NC_019392	GTT	2	6	566	571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410858955
13	NC_019392	T	6	6	573	578	0 %	100 %	0 %	0 %	410858955
14	NC_019392	A	6	6	716	721	100 %	0 %	0 %	0 %	410858955
15	NC_019392	AG	3	6	801	806	50 %	0 %	50 %	0 %	410858955
16	NC_019392	ACA	2	6	833	838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858955
17	NC_019392	CAAT	2	8	844	851	50 %	25 %	0 %	25 %	410858955
18	NC_019392	TAT	3	9	858	866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410858955
19	NC_019392	A	8	8	947	954	100 %	0 %	0 %	0 %	410858955
20	NC_019392	TCT	2	6	996	1001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410858955
21	NC_019392	T	7	7	1172	1178	0 %	100 %	0 %	0 %	410858956
22	NC_019392	TAG	2	6	1195	1200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410858956
23	NC_019392	T	7	7	1276	1282	0 %	100 %	0 %	0 %	410858956
24	NC_019392	TG	3	6	1336	1341	0 %	50 %	50 %	0 %	410858956
25	NC_019392	TTTC	2	8	1425	1432	0 %	75 %	0 %	25 %	410858956
26	NC_019392	TAA	2	6	1477	1482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410858956
27	NC_019392	TTG	2	6	1483	1488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410858956
28	NC_019392	AC	3	6	1495	1500	50 %	0 %	0 %	50 %	410858956
29	NC_019392	TGT	2	6	1556	1561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410858956
30	NC_019392	GAA	2	6	1597	1602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858956
31	NC_019392	ATA	2	6	1657	1662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410858956
32	NC_019392	TGA	2	6	1734	1739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410858956
33	NC_019392	ATT	2	6	1758	1763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410858956
34	NC_019392	TTAG	2	8	1788	1795	25 %	50 %	25 %	0 %	410858956
35	NC_019392	AT	3	6	1798	1803	50 %	50 %	0 %	0 %	410858956
36	NC_019392	TGC	2	6	1808	1813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410858956
37	NC_019392	AC	3	6	1841	1846	50 %	0 %	0 %	50 %	410858956
38	NC_019392	TGT	2	6	1885	1890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410858956
39	NC_019392	TTCT	2	8	1942	1949	0 %	75 %	0 %	25 %	410858956
40	NC_019392	AGA	2	6	1997	2002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858956
41	NC_019392	AGAA	2	8	2072	2079	75 %	0 %	25 %	0 %	410858956
42	NC_019392	GTT	2	6	2096	2101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410858956
43	NC_019392	CA	4	8	2162	2169	50 %	0 %	0 %	50 %	410858956
44	NC_019392	GAA	3	9	2283	2291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858957
45	NC_019392	T	6	6	2313	2318	0 %	100 %	0 %	0 %	410858957
46	NC_019392	ATT	2	6	2338	2343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410858957
47	NC_019392	TGT	3	9	2357	2365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410858957
48	NC_019392	CAC	2	6	2382	2387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410858957
49	NC_019392	AT	3	6	2410	2415	50 %	50 %	0 %	0 %	410858957
50	NC_019392	AT	3	6	2431	2436	50 %	50 %	0 %	0 %	410858957
51	NC_019392	CAATAT	2	12	2452	2463	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	410858957
52	NC_019392	AGA	2	6	2487	2492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858957
53	NC_019392	ATC	2	6	2566	2571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410858957
54	NC_019392	GATT	2	8	2849	2856	25 %	50 %	25 %	0 %	410858957
55	NC_019392	TTC	2	6	2882	2887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410858957
56	NC_019392	ATTAT	2	10	2904	2913	40 %	60 %	0 %	0 %	410858957
57	NC_019392	TGT	2	6	2927	2932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410858957
58	NC_019392	TGC	2	6	2936	2941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410858957
59	NC_019392	CAAAT	2	10	3043	3052	60 %	20 %	0 %	20 %	410858957
60	NC_019392	AG	3	6	3056	3061	50 %	0 %	50 %	0 %	410858957
61	NC_019392	CTT	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410858957
62	NC_019392	A	6	6	3297	3302	100 %	0 %	0 %	0 %	410858957
63	NC_019392	AGA	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858957
64	NC_019392	TGT	2	6	3436	3441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410858957
65	NC_019392	TAT	2	6	3510	3515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410858957
66	NC_019392	TAG	2	6	3550	3555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410858957
67	NC_019392	CAA	2	6	3583	3588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858957
68	NC_019392	AAG	2	6	3631	3636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858957
69	NC_019392	AGA	2	6	3718	3723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858958
70	NC_019392	AGC	2	6	3811	3816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410858958
71	NC_019392	CAA	2	6	3837	3842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858958
72	NC_019392	TTAT	2	8	3868	3875	25 %	75 %	0 %	0 %	410858958
73	NC_019392	A	7	7	3961	3967	100 %	0 %	0 %	0 %	410858958
74	NC_019392	AAG	2	6	4005	4010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858958
75	NC_019392	GAA	2	6	4094	4099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858958
76	NC_019392	TC	3	6	4122	4127	0 %	50 %	0 %	50 %	410858958
77	NC_019392	GAA	2	6	4190	4195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858958
78	NC_019392	A	6	6	4217	4222	100 %	0 %	0 %	0 %	410858958
79	NC_019392	TCA	2	6	4233	4238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410858958
80	NC_019392	TAG	2	6	4257	4262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410858958
81	NC_019392	A	8	8	4387	4394	100 %	0 %	0 %	0 %	410858958
82	NC_019392	AAATAG	2	12	4428	4439	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	410858958
83	NC_019392	AT	3	6	4477	4482	50 %	50 %	0 %	0 %	410858958
84	NC_019392	A	7	7	4499	4505	100 %	0 %	0 %	0 %	410858958
85	NC_019392	AAAC	2	8	4558	4565	75 %	0 %	0 %	25 %	410858958
86	NC_019392	A	6	6	4595	4600	100 %	0 %	0 %	0 %	410858958
87	NC_019392	TATTT	2	10	4605	4614	20 %	80 %	0 %	0 %	410858958
88	NC_019392	CAA	2	6	4641	4646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858958
89	NC_019392	CAA	2	6	4665	4670	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858958
90	NC_019392	CAA	2	6	4830	4835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858959
91	NC_019392	CAG	2	6	4864	4869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410858959
92	NC_019392	CCA	2	6	4930	4935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410858959
93	NC_019392	AAG	2	6	5041	5046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858959
94	NC_019392	AAT	2	6	5057	5062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410858959
95	NC_019392	A	6	6	5116	5121	100 %	0 %	0 %	0 %	410858959
96	NC_019392	TTTA	2	8	5135	5142	25 %	75 %	0 %	0 %	410858959
97	NC_019392	CTG	2	6	5233	5238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410858959
98	NC_019392	CAT	2	6	5240	5245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410858959
99	NC_019392	TCA	2	6	5328	5333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410858959
100	NC_019392	TGTT	2	8	5345	5352	0 %	75 %	25 %	0 %	410858959
101	NC_019392	ACA	2	6	5371	5376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858959
102	NC_019392	TC	3	6	5398	5403	0 %	50 %	0 %	50 %	410858959
103	NC_019392	TGG	2	6	5411	5416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410858959
104	NC_019392	GTG	2	6	5425	5430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410858959
105	NC_019392	AT	3	6	5491	5496	50 %	50 %	0 %	0 %	410858959
106	NC_019392	ACA	2	6	5513	5518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858959
107	NC_019392	TAA	2	6	5529	5534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410858959
108	NC_019392	ATGA	2	8	5626	5633	50 %	25 %	25 %	0 %	410858960
109	NC_019392	A	6	6	5726	5731	100 %	0 %	0 %	0 %	410858960
110	NC_019392	T	6	6	5736	5741	0 %	100 %	0 %	0 %	410858960
111	NC_019392	ACTT	2	8	5789	5796	25 %	50 %	0 %	25 %	410858960
112	NC_019392	ATA	2	6	5858	5863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410858960
113	NC_019392	A	7	7	5874	5880	100 %	0 %	0 %	0 %	410858960
114	NC_019392	GGT	2	6	5995	6000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	410858961
115	NC_019392	AAC	2	6	6009	6014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858961
116	NC_019392	GTA	2	6	6032	6037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410858961
117	NC_019392	A	7	7	6057	6063	100 %	0 %	0 %	0 %	410858961
118	NC_019392	GAT	2	6	6127	6132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410858961
119	NC_019392	AGA	2	6	6172	6177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858961
120	NC_019392	CATA	2	8	6180	6187	50 %	25 %	0 %	25 %	410858961
121	NC_019392	AGA	2	6	6234	6239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858961
122	NC_019392	ATG	2	6	6317	6322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410858961
123	NC_019392	CCT	2	6	6340	6345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410858961
124	NC_019392	AAG	2	6	6365	6370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858961
125	NC_019392	TG	3	6	6396	6401	0 %	50 %	50 %	0 %	410858961
126	NC_019392	CAA	2	6	6458	6463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858961
127	NC_019392	T	6	6	6494	6499	0 %	100 %	0 %	0 %	410858961
128	NC_019392	GAAA	2	8	6511	6518	75 %	0 %	25 %	0 %	410858961
129	NC_019392	CAA	2	6	6521	6526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	410858961
130	NC_019392	CAG	2	6	6606	6611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410858961
131	NC_019392	TTA	2	6	6616	6621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	410858961
132	NC_019392	ATC	2	6	6627	6632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410858961
133	NC_019392	TAA	2	6	6635	6640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410858961
134	NC_019392	AGC	2	6	6660	6665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410858961
135	NC_019392	TGA	2	6	6714	6719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410858961
136	NC_019392	ATTA	2	8	6749	6756	50 %	50 %	0 %	0 %	410858962
137	NC_019392	AAG	2	6	6757	6762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410858962
138	NC_019392	T	7	7	6770	6776	0 %	100 %	0 %	0 %	410858962
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.